Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OatP29758 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OatP29758 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OatP29758 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OatP29758 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OatP29758 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OatP29758 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OatP29758 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OatP29758 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OatP29758 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OatP29758 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OatP29758 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OatP29758 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OatP29758 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OatP29758 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OatP29758 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OatP29758 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OatP29758 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms