Protein–RNA interactions for Protein: P29391

Ftl1, Ferritin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftl1P29391 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftl1P29391 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftl1P29391 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftl1P29391 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftl1P29391 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ftl1P29391 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ftl1P29391 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ftl1P29391 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms