Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RxraP28700 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RxraP28700 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RxraP28700 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RxraP28700 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RxraP28700 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RxraP28700 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RxraP28700 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RxraP28700 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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