Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms