Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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Hoxd10P28359 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hoxd10P28359 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd10P28359 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Hoxd10P28359 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd10P28359 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Hoxd10P28359 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd10P28359 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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