Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv4P28322 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms