Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LoxP28301 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LoxP28301 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LoxP28301 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LoxP28301 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LoxP28301 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LoxP28301 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LoxP28301 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LoxP28301 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms