Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CebpbP28033 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CebpbP28033 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms