Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BrafP28028 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BrafP28028 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BrafP28028 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BrafP28028 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BrafP28028 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BrafP28028 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BrafP28028 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BrafP28028 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BrafP28028 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms