Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrg3P27681 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabrg3P27681 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabrg3P27681 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms