Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PdgfraP26618 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms