Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af2P26369 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms