Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd11P23813 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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