Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ggta1P23336 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ggta1P23336 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms