Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Eif3aP23116 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3aP23116 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms