Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myd88P22366 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myd88P22366 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myd88P22366 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myd88P22366 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms