Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcer1aP20489 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms