Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP20293 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP20293 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TP20293 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TP20293 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP20293 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP20293 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP20293 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP20293 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TP20293 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TP20293 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP20293 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms