Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps6ka1P18653 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms