Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18528 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18528 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18528 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18528 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18528 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18528 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18528 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms