Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18526 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18526 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18526 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18526 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18526 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18526 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18526 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18526 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18526 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18526 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms