Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SellP18337 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SellP18337 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SellP18337 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SellP18337 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SellP18337 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SellP18337 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SellP18337 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SellP18337 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SellP18337 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SellP18337 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SellP18337 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SellP18337 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SellP18337 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SellP18337 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms