Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcna1P16388 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcna1P16388 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcna1P16388 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms