Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CnpP16330 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CnpP16330 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CnpP16330 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CnpP16330 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CnpP16330 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CnpP16330 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CnpP16330 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CnpP16330 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CnpP16330 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CnpP16330 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CnpP16330 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CnpP16330 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CnpP16330 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CnpP16330 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CnpP16330 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CnpP16330 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CnpP16330 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CnpP16330 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CnpP16330 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.9 ms