Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms