Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DmdP11531 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DmdP11531 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DmdP11531 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DmdP11531 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
DmdP11531 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DmdP11531 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DmdP11531 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DmdP11531 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DmdP11531 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DmdP11531 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DmdP11531 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DmdP11531 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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