Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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