Protein–RNA interactions for Protein: P10922

H1f0, Histone H1.0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1f0P10922 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1f0P10922 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H1f0P10922 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms