Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nid1P10493 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nid1P10493 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms