Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb4P10284 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms