Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms