Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms