Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms