Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf2P09926 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf2P09926 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms