Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csf3P09920 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csf3P09920 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms