Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxb5P09079 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hoxb5P09079 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb5P09079 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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