Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa1P09022 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms