Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna4P07351 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms