Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna6P07350 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna6P07350 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms