Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprcP06800 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PtprcP06800 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprcP06800 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprcP06800 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprcP06800 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms