Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P06344 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P06344 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06344 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06344 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P06344 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06344 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P06344 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P06344 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06344 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06344 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms