Protein–RNA interactions for Protein: P04941

Ig kappa chain V-VI region NQ2-48.2.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04941 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04941 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04941 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04941 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04941 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04941 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04941 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P04941 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04941 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04941 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms