Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P04213 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04213 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P04213 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P04213 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04213 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P04213 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P04213 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P04213 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms