Protein–RNA interactions for Protein: P02525

Cryba1, Beta-crystallin A1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba1P02525 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cryba1P02525 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cryba1P02525 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms