Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01806 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01806 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01806 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01806 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01806 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01806 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01806 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms