Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01798 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01798 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01798 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01798 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01798 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01798 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms