Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01789 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01789 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01789 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01789 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01789 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01789 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01789 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01789 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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