Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01748 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01748 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01748 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01748 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01748 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01748 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01748 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01748 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01748 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01748 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01748 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01748 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01748 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01748 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01748 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01748 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01748 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01748 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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