Protein–RNA interactions for Protein: P01723

Ig lambda-1 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01723 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01723 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01723 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01723 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01723 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01723 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01723 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01723 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01723 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms