Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01656 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01656 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01656 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01656 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01656 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01656 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01656 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01656 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01656 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms